Respecto a conectar dos pares de parlantes y obviamente usarlos a la vez, la impedancia resultante dependerá de si el ampli realiza la suma de ambos en paralelo o en serie. Normalmente no lo especifican, así que como no lo sabemos hay que hacer caso al manual y respetar la impedancia mínima indicada.
Normalmente cada par debería ser de la misma impedancia, porque independiente le haga bien o mal al ampli, se provocaría un notorio desbalance sonoro (si es que los tenemos en la misma habitación).
Aún así, si queremos jugar un rato, y sabemos el rango de impedancia admitida por el ampli y sabemos si el conmutador A+B hace la suma en paralelo o en serie, es cosa de aplicar la ley de ohm.
Si por ejemplo, conectamos 2 pares de 8 ohms en serie, la resistencia total es de 16 ohms (por canal), si el ampli lo permite, dale, estarías dentro del rango. Pero si conectamos en paralelo 2 pares de 8 ohms, la resistencia total es de 4 ohms. Por esto último algunos amplis dicen explícitamente, que de conectar dos pares, éstos sean mínimo de 8 ohms (para cumplir con el mínimo admitido de 4 ohms).
En fin, lo que hayas conectado se ve todo bien, así que no fue tu culpa. Los amplis son como un auto, necesitan mantención, y si ves que la temperatura estaba fuera de lo normal es porque algo andaba mal. Y como todo en electrónica, cuando hay problemas se deben hacer mediciones para determinar de dónde viene la falla y reparar o ajustar lo que corresponda.
Saludos!
[Edit] Estuve leyendo más arriba y dices que conectaste 2 pares de 6 ohms, en ese caso la impedancia total (si estuvieran en paralelo) sería de 3 ohms, o sea fuera del rango. En el fondo, cuando la impedancia es menor, te acercas al "cortocircuito" o a un mayor flujo eléctrico, por eso es que los amplis se calientan más con bajas impedancias que con altas, tal vez aquí anduviste mal